Чрелл это утром мутант
Все утромы имеют стандартный окрас розовый, только Чрелл красный. И вероятно он попал под действие мутагена, как Крэнг из 2012. И его мутация поменяла ему отенок кожи. Также возможно мутаген повлиял на его мозг, сделав его умнее и злее. Ведь Чрелл единственный красный утром, и ещё красный злой утром. Да там были другие плохие утромы, но, во-первых, они вряд ли были красного, и во вторых не такие злые.

У Чрелла был помощник!
Помните в одной из серии, показали утрома по имени Крэнг. И Крэнг всегда был, главным врагом черепашек. Так что версии 2003 мешает ему быть злодеем? Именно Крэнг саботировал корабль утромов, а затем шпионил за утромами.

Ороку Саки и Тянг Шен были парой
В серии «Легенды о Ёкай» когда Саки вёл диалог с Шен, стало понятно Шен его бывшая. Зачем Шреддеру говорить – Вернись ко мне Шен, я не такой, как был раньше.
Шреддер и Шен были вместе, но Йоши завидовал Саки и отбил его девушку. Возможно подставил, опозорил его. И именно по этой причине Шреддер ненавидеть Сплинтера. Ведь если Хамато Йоши не увёл Тянг Шен, не было бы вражды между братьями, и Шреддер не убил Шен.

Шреддер и Сплинтер это позывные
В одной из серии, Шреддер показал фотографию где он и Йоши показан с военным жетоном. И да они принимали участие военных действий, это прямо жирный намёк. К сожалению нет информации, в какой стране они воевали. Вроде Япония не участвовала в войнах, но Клан Хамато брал участие военных действий других стран. И всем военным дают позывные, то когда Йоши и Саки вступили на тропу войны, они и стали Сплинтером и Шреддером.